Branch data Line data Source code
1 : : #ifndef SEQUENCE_DATA_HPP
2 : : #define SEQUENCE_DATA_HPP
3 : :
4 : : #include "TypeSequenceManager.hpp"
5 : :
6 : : #include <vector>
7 : : #include <stdlib.h>
8 : : #include <string.h>
9 : :
10 : : namespace moab
11 : : {
12 : :
13 : : class SequenceData
14 : : {
15 : : public:
16 : : typedef std::vector< EntityHandle >* AdjacencyDataType;
17 : :
18 : : /**\param num_sequence_arrays Number of data arrays needed by the EntitySequence
19 : : * \param start First handle in this SequenceData
20 : : * \param end Last handle in this SequenceData
21 : : */
22 : : inline SequenceData( int num_sequence_arrays, EntityHandle start, EntityHandle end );
23 : :
24 : : virtual ~SequenceData();
25 : :
26 : : /**\return first handle in this sequence data */
27 : 62179778 : EntityHandle start_handle() const
28 : : {
29 : 62179778 : return startHandle;
30 : : }
31 : :
32 : : /**\return last handle in this sequence data */
33 : 17612708 : EntityHandle end_handle() const
34 : : {
35 : 17612708 : return endHandle;
36 : : }
37 : :
38 : 184115 : EntityID size() const
39 : : {
40 : 184115 : return endHandle + 1 - startHandle;
41 : : }
42 : :
43 : : /**\return ith array of EnitySequence-specific data */
44 : 71476771 : void* get_sequence_data( int array_num )
45 : : {
46 : 71476771 : return arraySet[-1 - array_num];
47 : : }
48 : : /**\return ith array of EnitySequence-specific data */
49 : 2 : void const* get_sequence_data( int array_num ) const
50 : : {
51 : 2 : return arraySet[-1 - array_num];
52 : : }
53 : :
54 : : /**\return array of adjacency data, or NULL if none. */
55 : 10156170 : AdjacencyDataType* get_adjacency_data()
56 : : {
57 : 10156170 : return reinterpret_cast< AdjacencyDataType* >( arraySet[0] );
58 : : }
59 : : /**\return array of adjacency data, or NULL if none. */
60 : 6 : AdjacencyDataType const* get_adjacency_data() const
61 : : {
62 : 6 : return reinterpret_cast< AdjacencyDataType const* >( arraySet[0] );
63 : : }
64 : :
65 : : /**\return array of dense tag data, or NULL if none. */
66 : 7312120 : void* get_tag_data( unsigned tag_num )
67 : : {
68 [ + + ]: 7312120 : return tag_num < numTagData ? arraySet[tag_num + 1] : 0;
69 : : }
70 : : /**\return array of dense tag data, or NULL if none. */
71 : : void const* get_tag_data( unsigned tag_num ) const
72 : : {
73 : : return tag_num < numTagData ? arraySet[tag_num + 1] : 0;
74 : : }
75 : :
76 : : /**\brief Allocate array of sequence-specific data
77 : : *
78 : : * Allocate an array of EntitySequence-specific data.
79 : : *\param array_num Index for which to allocate array.
80 : : * Must be in [0,num_sequence_arrays], where
81 : : * num_sequence_arrays is constructor argument.
82 : : *\param bytes_per_ent Bytes to allocate for each entity.
83 : : *\param initial_val Value to initialize array with. If non-null, must
84 : : * be bytes_per_ent long. If NULL, array will be zeroed.
85 : : *\return The newly allocated array, or NULL if error.
86 : : */
87 : : void* create_sequence_data( int array_num, int bytes_per_ent, const void* initial_val = 0 );
88 : :
89 : : /**\brief Allocate array of sequence-specific data
90 : : *
91 : : * Allocate an array of EntitySequence-specific data.
92 : : *\param array_num Index for which to allocate array.
93 : : * Must be in [0,num_sequence_arrays], where
94 : : * num_sequence_arrays is constructor argument.
95 : : *\return The newly allocated array, or NULL if error.
96 : : */
97 : : void* create_custom_data( int array_num, size_t total_bytes );
98 : :
99 : : /**\brief Allocate array for storing adjacency data.
100 : : *
101 : : * Allocate array for storing adjacency data.
102 : : *\return The newly allocated array, or NULL if already allocated.
103 : : */
104 : : AdjacencyDataType* allocate_adjacency_data();
105 : :
106 : : /**\brief Allocate array of dense tag data
107 : : *
108 : : * Allocate an array of dense tag data.
109 : : *\param index Dense tag ID for which to allocate array.
110 : : *\param bytes_per_ent Bytes to allocate for each entity.
111 : : *\return The newly allocated array, or NULL if error.
112 : : */
113 : : void* allocate_tag_array( int index, int bytes_per_ent, const void* default_value = 0 );
114 : :
115 : : /**\brief Create new SequenceData that is a copy of a subset of this one
116 : : *
117 : : * Create a new SequenceData that is a copy of a subset of this one.
118 : : * This function is intended for use in subdividing a SequenceData
119 : : * for operations such as changing the number of nodes in a block of
120 : : * elements.
121 : : *\param start First handle for resulting subset
122 : : *\param end Last handle for resulting subset
123 : : *\param sequence_data_sizes Bytes-per-entity for sequence-specific data.
124 : : *\NOTE Does not copy tag data.
125 : : */
126 : : SequenceData* subset( EntityHandle start, EntityHandle end, const int* sequence_data_sizes ) const;
127 : :
128 : : /**\brief SequenceManager data */
129 : : TypeSequenceManager::SequenceDataPtr seqManData;
130 : :
131 : : /**\brief Move tag data for a subset of this sequences to specified sequence */
132 : : void move_tag_data( SequenceData* destination, const int* tag_sizes, int num_tag_sizes );
133 : :
134 : : /**\brief Free all tag data arrays */
135 : : void release_tag_data( const int* tag_sizes, int num_tag_sizes );
136 : : /**\brief Free specified tag data array */
137 : : void release_tag_data( int index, int tag_size );
138 : :
139 : : protected:
140 : : SequenceData( const SequenceData* subset_from, EntityHandle start, EntityHandle end,
141 : : const int* sequence_data_sizes );
142 : :
143 : : private:
144 : : void increase_tag_count( unsigned by_this_many );
145 : :
146 : : void* create_data( int index, int bytes_per_ent, const void* initial_val = 0 );
147 : : void copy_data_subset( int index, int size_per_ent, const void* source, size_t offset, size_t count );
148 : :
149 : : const int numSequenceData;
150 : : unsigned numTagData;
151 : : void** arraySet;
152 : : EntityHandle startHandle, endHandle;
153 : : };
154 : :
155 : 1506 : inline SequenceData::SequenceData( int num_sequence_arrays, EntityHandle start, EntityHandle end )
156 : 1506 : : numSequenceData( num_sequence_arrays ), numTagData( 0 ), startHandle( start ), endHandle( end )
157 : : {
158 : 1506 : const size_t sz = sizeof( void* ) * ( num_sequence_arrays + 1 );
159 : 1506 : void** data = (void**)malloc( sz );
160 : 1506 : memset( data, 0, sz );
161 : 1506 : arraySet = data + num_sequence_arrays;
162 : 1506 : }
163 : :
164 : : } // namespace moab
165 : :
166 : : #endif
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