LCOV - code coverage report
Current view: top level - src/io - Tqdcfr.hpp (source / functions) Hit Total Coverage
Test: coverage_sk.info Lines: 1 5 20.0 %
Date: 2020-12-16 07:07:30 Functions: 1 11 9.1 %
Branches: 0 18 0.0 %

           Branch data     Line data    Source code
       1                 :            : /**
       2                 :            :  * MOAB, a Mesh-Oriented datABase, is a software component for creating,
       3                 :            :  * storing and accessing finite element mesh data.
       4                 :            :  *
       5                 :            :  * Copyright 2004 Sandia Corporation.  Under the terms of Contract
       6                 :            :  * DE-AC04-94AL85000 with Sandia Corporation, the U.S. Government
       7                 :            :  * retains certain rights in this software.
       8                 :            :  *
       9                 :            :  * This library is free software; you can redistribute it and/or
      10                 :            :  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
      11                 :            :  * License as published by the Free Software Foundation; either
      12                 :            :  * version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
      13                 :            :  *
      14                 :            :  */
      15                 :            : 
      16                 :            : /*
      17                 :            :  * Tim's Quick 'N Dirty Cub File Reader (Tqdcfr)
      18                 :            :  *
      19                 :            :  */
      20                 :            : 
      21                 :            : #ifndef TQDCFR
      22                 :            : #define TQDCFR
      23                 :            : 
      24                 :            : #include "moab/Forward.hpp"
      25                 :            : #include "moab/ReaderIface.hpp"
      26                 :            : #include "MBTagConventions.hpp"
      27                 :            : #include "moab/Range.hpp"
      28                 :            : 
      29                 :            : #include <stdio.h>
      30                 :            : #include <string>
      31                 :            : #include <vector>
      32                 :            : #include <map>
      33                 :            : 
      34                 :            : namespace moab
      35                 :            : {
      36                 :            : 
      37                 :            : class ReadUtilIface;
      38                 :            : class FEModelHeader;
      39                 :            : class GeomHeader;
      40                 :            : class GroupHeader;
      41                 :            : class BlockHeader;
      42                 :            : class NodesetHeader;
      43                 :            : class SidesetHeader;
      44                 :            : 
      45                 :            : class Tqdcfr : public ReaderIface
      46                 :            : {
      47                 :            :   public:
      48                 :            :     void FSEEK( unsigned offset );                           // set cubFile offset to specified value
      49                 :            :     void FREADI( unsigned num_ents );                        // read integers into uint_buf
      50                 :            :     void FREADD( unsigned num_ents );                        // read doubles into dbl_buf
      51                 :            :     void FREADC( unsigned num_ents );                        // read characters into char_buf
      52                 :            :     void FREADIA( unsigned num_ents, unsigned int* array );  // read integers
      53                 :            :     void FREADDA( unsigned num_ents, double* array );        // read doubles
      54                 :            :     void FREADCA( unsigned num_ents, char* arrat );          // read bytes
      55                 :            :     void CONVERT_TO_INTS( unsigned int num_ents );           // convert uint_buf to int_buf in-place
      56                 :            : 
      57                 :            :     // class for holding the file table of contents
      58                 :            :     class FileTOC
      59                 :            :     {
      60                 :            :       public:
      61                 :            :         unsigned int fileEndian, fileSchema, numModels, modelTableOffset, modelMetaDataOffset, activeFEModel;
      62                 :            : 
      63                 :            :         FileTOC();
      64                 :            :         void print();
      65                 :            :     };
      66                 :            : 
      67                 :            :     //
      68                 :          0 :     class FEModelHeader
      69                 :            :     {
      70                 :            :       public:
      71                 :            :         unsigned int feEndian, feSchema, feCompressFlag, feLength;
      72                 :            : 
      73                 :            :         class ArrayInfo
      74                 :            :         {
      75                 :            :           public:
      76                 :            :             unsigned numEntities, tableOffset, metaDataOffset;
      77                 :            : 
      78                 :            :             ArrayInfo();
      79                 :            : 
      80                 :            :             void print();
      81                 :            :             void init( const std::vector< unsigned int >& uint_buf_in );
      82                 :            :         };
      83                 :            : 
      84                 :            :         ArrayInfo geomArray, nodeArray, elementArray, groupArray, blockArray, nodesetArray, sidesetArray;
      85                 :            : 
      86                 :            :         void init( const unsigned int offset, Tqdcfr* instance );
      87                 :            : 
      88                 :            :         void print();
      89                 :            :     };
      90                 :            : 
      91                 :          2 :     class MetaDataContainer
      92                 :            :     {
      93                 :            :       public:
      94                 :            :         unsigned int mdSchema, compressFlag;
      95                 :            : 
      96 [ #  # ][ #  # ]:          0 :         class MetaDataEntry
                 [ #  # ]
      97                 :            :         {
      98                 :            :           public:
      99                 :            :             unsigned int mdOwner, mdDataType, mdIntValue;
     100                 :            :             std::string mdName, mdStringValue;
     101                 :            :             std::vector< unsigned int > mdIntArrayValue;
     102                 :            :             double mdDblValue;
     103                 :            :             std::vector< double > mdDblArrayValue;
     104                 :            : 
     105                 :            :             MetaDataEntry();
     106                 :            : 
     107                 :            :             void print();
     108                 :            :         };
     109                 :            : 
     110                 :            :         void print();
     111                 :            : 
     112                 :            :         int get_md_entry( const unsigned int owner, const std::string& name );
     113                 :            : 
     114                 :            :         std::vector< MetaDataEntry > metadataEntries;
     115                 :            :         MetaDataContainer();
     116                 :            :     };
     117                 :            : 
     118                 :            :     class GeomHeader
     119                 :            :     {
     120                 :            :       public:
     121                 :            :         unsigned int geomID, nodeCt, nodeOffset, elemCt, elemOffset, elemTypeCt, elemLength;
     122                 :            : 
     123                 :            :         int maxDim;
     124                 :            : 
     125                 :            :         EntityHandle setHandle;
     126                 :            : 
     127                 :            :         void print();
     128                 :            : 
     129                 :            :         static ErrorCode read_info_header( const unsigned int model_offset, const FEModelHeader::ArrayInfo& info,
     130                 :            :                                            Tqdcfr* instance, GeomHeader*& entity_headers );
     131                 :            : 
     132                 :            :         GeomHeader();
     133                 :            :     };
     134                 :            : 
     135                 :            :     class GroupHeader
     136                 :            :     {
     137                 :            :       public:
     138                 :            :         unsigned int grpID, grpType, memCt, memOffset, memTypeCt, grpLength;
     139                 :            : 
     140                 :            :         EntityHandle setHandle;
     141                 :            : 
     142                 :            :         void print();
     143                 :            : 
     144                 :            :         static ErrorCode read_info_header( const unsigned int model_offset, const FEModelHeader::ArrayInfo& info,
     145                 :            :                                            Tqdcfr* instance, GroupHeader*& entity_headers );
     146                 :            : 
     147                 :            :         GroupHeader();
     148                 :            :     };
     149                 :            : 
     150                 :            :     class BlockHeader
     151                 :            :     {
     152                 :            :       public:
     153                 :            :         unsigned int blockID, blockElemType, memCt, memOffset, memTypeCt, attribOrder, blockCol, blockMixElemType,
     154                 :            :             blockPyrType, blockMat, blockLength, blockDim;
     155                 :            : 
     156                 :            :         EntityHandle setHandle;
     157                 :            : 
     158                 :            :         EntityType blockEntityType;
     159                 :            : 
     160                 :            :         int hasMidNodes[4];
     161                 :            : 
     162                 :            :         void print();
     163                 :            : 
     164                 :            :         static ErrorCode read_info_header( const double data_version, const unsigned int model_offset,
     165                 :            :                                            const FEModelHeader::ArrayInfo& info, Tqdcfr* instance,
     166                 :            :                                            BlockHeader*& block_headers );
     167                 :            : 
     168                 :            :         BlockHeader();
     169                 :            :     };
     170                 :            : 
     171                 :            :     class NodesetHeader
     172                 :            :     {
     173                 :            :       public:
     174                 :            :         unsigned int nsID, memCt, memOffset, memTypeCt, pointSym, nsCol, nsLength;
     175                 :            : 
     176                 :            :         EntityHandle setHandle;
     177                 :            : 
     178                 :            :         void print();
     179                 :            : 
     180                 :            :         static ErrorCode read_info_header( const unsigned int model_offset, const FEModelHeader::ArrayInfo& info,
     181                 :            :                                            Tqdcfr* instance, NodesetHeader*& entity_headers );
     182                 :            : 
     183                 :            :         NodesetHeader();
     184                 :            :     };
     185                 :            : 
     186                 :            :     class SidesetHeader
     187                 :            :     {
     188                 :            :       public:
     189                 :            :         unsigned int ssID, memCt, memOffset, memTypeCt, numDF, ssCol, useShell, ssLength;
     190                 :            : 
     191                 :            :         EntityHandle setHandle;
     192                 :            : 
     193                 :            :         void print();
     194                 :            : 
     195                 :            :         static ErrorCode read_info_header( const unsigned int model_offset, const FEModelHeader::ArrayInfo& info,
     196                 :            :                                            Tqdcfr* instance, SidesetHeader*& entity_headers );
     197                 :            : 
     198                 :            :         SidesetHeader();
     199                 :            :     };
     200                 :            : 
     201                 :            :     // class to hold model entry data for various kinds of models
     202                 :            :     // (acis, free mesh, etc.)
     203 [ #  # ][ #  # ]:          0 :     class ModelEntry
         [ #  # ][ #  # ]
         [ #  # ][ #  # ]
     204                 :            :     {
     205                 :            :       public:
     206                 :            :         ModelEntry();
     207                 :            : 
     208                 :            :         ~ModelEntry();
     209                 :            : 
     210                 :            :         unsigned int modelHandle, modelOffset, modelLength, modelType, modelOwner, modelPad;
     211                 :            : 
     212                 :            :         FEModelHeader feModelHeader;
     213                 :            :         GeomHeader* feGeomH;
     214                 :            :         GroupHeader* feGroupH;
     215                 :            :         BlockHeader* feBlockH;
     216                 :            :         NodesetHeader* feNodeSetH;
     217                 :            :         SidesetHeader* feSideSetH;
     218                 :            : 
     219                 :            :         MetaDataContainer geomMD, nodeMD, elementMD, groupMD, blockMD, nodesetMD, sidesetMD;
     220                 :            : 
     221                 :            :         void print();
     222                 :            : 
     223                 :            :         void print_geom_headers( const char* prefix, GeomHeader* header, unsigned int num_headers );
     224                 :            : 
     225                 :            :         void print_group_headers( const char* prefix, GroupHeader* header, const unsigned int num_headers );
     226                 :            : 
     227                 :            :         void print_block_headers( const char* prefix, BlockHeader* header, const unsigned int num_headers );
     228                 :            : 
     229                 :            :         void print_nodeset_headers( const char* prefix, NodesetHeader* header, const unsigned int num_headers );
     230                 :            : 
     231                 :            :         void print_sideset_headers( const char* prefix, SidesetHeader* header, const unsigned int num_headers );
     232                 :            : 
     233                 :            :         ErrorCode read_header_info( Tqdcfr* instance, const double data_version );
     234                 :            :         ErrorCode read_metadata_info( Tqdcfr* tqd );
     235                 :            :     };
     236                 :            : 
     237                 :            :     enum
     238                 :            :     {
     239                 :            :         aBODY,
     240                 :            :         LUMP,
     241                 :            :         SHELL,
     242                 :            :         FACE,
     243                 :            :         LOOP,
     244                 :            :         COEDGE,
     245                 :            :         aEDGE,
     246                 :            :         aVERTEX,
     247                 :            :         ATTRIB,
     248                 :            :         UNKNOWN
     249                 :            :     };
     250                 :            : 
     251                 :          0 :     struct AcisRecord
     252                 :            :     {
     253                 :            :         unsigned int rec_type;
     254                 :            :         std::string att_string;
     255                 :            :         bool processed;
     256                 :            :         int first_attrib;
     257                 :            :         int att_prev, att_next, att_ent_num;
     258                 :            :         EntityHandle entity;
     259                 :            :     };
     260                 :            : 
     261                 :            :     ~Tqdcfr();
     262                 :            : 
     263                 :            :     ReadUtilIface* readUtilIface;
     264                 :            :     Interface* mdbImpl;
     265                 :            :     FILE* cubFile;
     266                 :            :     FileTOC fileTOC;
     267                 :            :     std::vector< ModelEntry > modelEntries;
     268                 :            :     MetaDataContainer modelMetaData;
     269                 :            :     long currVHandleOffset;
     270                 :            :     Range beforeEnts;
     271                 :            :     long currElementIdOffset[MBMAXTYPE];
     272                 :            :     Tag globalIdTag, cubIdTag, geomTag, uniqueIdTag, blockTag, nsTag, ssTag, attribVectorTag, entityNameTag,
     273                 :            :         categoryTag, hasMidNodesTag;
     274                 :            :     std::map< int, EntityHandle > uidSetMap;
     275                 :            :     std::map< int, EntityHandle > gidSetMap[6];
     276                 :            :     bool swapForEndianness;
     277                 :            : 
     278                 :            :     std::vector< unsigned int > uint_buf;
     279                 :            :     int* int_buf;
     280                 :            :     std::vector< double > dbl_buf;
     281                 :            :     std::vector< char > char_buf;
     282                 :            : 
     283                 :            :     static ReaderIface* factory( Interface* );
     284                 :            : 
     285                 :            :     // read cub file
     286                 :            :     ErrorCode load_file( const char* file_name, const EntityHandle* file_set, const FileOptions& opts,
     287                 :            :                          const SubsetList* subset_list = 0, const Tag* file_id_tag = 0 );
     288                 :            : 
     289                 :            :     ErrorCode read_tag_values( const char* file_name, const char* tag_name, const FileOptions& opts,
     290                 :            :                                std::vector< int >& tag_values_out, const SubsetList* subset_list = 0 );
     291                 :            : 
     292                 :            :     ErrorCode read_nodeset( const unsigned int nsindex, ModelEntry* model, NodesetHeader* nodeseth );
     293                 :            :     ErrorCode read_sideset( const unsigned int ssindex, const double data_version, ModelEntry* model,
     294                 :            :                             SidesetHeader* sideseth );
     295                 :            :     ErrorCode read_block( const unsigned int blindex, const double data_version, ModelEntry* model,
     296                 :            :                           BlockHeader* blockh );
     297                 :            :     ErrorCode read_group( const unsigned int gr_index, ModelEntry* model, GroupHeader* grouph );
     298                 :            :     ErrorCode read_nodes( const unsigned int gindex, ModelEntry* model, GeomHeader* entity );
     299                 :            :     ErrorCode read_elements( ModelEntry* model, GeomHeader* entity );
     300                 :            :     ErrorCode read_file_header();
     301                 :            :     ErrorCode read_model_entries();
     302                 :            :     int find_model( const unsigned int model_type );
     303                 :            :     ErrorCode read_meta_data( const unsigned int metadata_offset, MetaDataContainer& mc );
     304                 :            :     ErrorCode read_md_string( std::string& name );
     305                 :            : 
     306                 :            :     enum
     307                 :            :     {
     308                 :            :         mesh,
     309                 :            :         acist,
     310                 :            :         acisb,
     311                 :            :         facet,
     312                 :            :         exodusmesh
     313                 :            :     };
     314                 :            :     EntityType type_from_cub_type( const unsigned int cub_type, const unsigned int nodes_per_elem );
     315                 :            :     void check_contiguous( const unsigned int num_ents, int& contig, unsigned int& min_id, unsigned int& max_id );
     316                 :            : 
     317                 :            :     Tqdcfr( Interface* impl );
     318                 :            : 
     319                 :            :     ErrorCode create_set( EntityHandle& h, unsigned int flags = MESHSET_SET );
     320                 :            : 
     321                 :            :   private:
     322                 :            :     EntityHandle mFileSet;  // set containing read entities.
     323                 :            : 
     324                 :            :     bool printedSeqWarning;  // only print acis sequence #'s warning once
     325                 :            : 
     326                 :            :     bool printedElemWarning;  // only print element #'s warning once
     327                 :            : 
     328                 :            :     ErrorCode convert_nodesets_sidesets();
     329                 :            : 
     330                 :            :     ErrorCode read_acis_records( const char* sat_file_name = 0 );
     331                 :            : 
     332                 :            :     ErrorCode parse_acis_attribs( const unsigned int entity_rec_num, std::vector< AcisRecord >& records );
     333                 :            :     ErrorCode interpret_acis_records( std::vector< AcisRecord >& records );
     334                 :            : 
     335                 :            :     ErrorCode reset_record( AcisRecord& this_record );
     336                 :            : 
     337                 :            :     ErrorCode process_record( AcisRecord& this_record );
     338                 :            : 
     339                 :            :     static const char geom_categories[][CATEGORY_TAG_SIZE];
     340                 :            : 
     341                 :            :     FILE* acisDumpFile;
     342                 :            : 
     343                 :            :     // map between cub ids and MOAB handles
     344                 :            :     std::vector< EntityHandle >* cubMOABVertexMap;
     345                 :            : 
     346                 :            :     // enum used to identify element/entity type in groups
     347                 :            :     enum
     348                 :            :     {
     349                 :            :         GROUP = 0,
     350                 :            :         BODY,
     351                 :            :         VOLUME,
     352                 :            :         SURFACE,
     353                 :            :         CURVE,
     354                 :            :         VERTEX,
     355                 :            :         HEX,
     356                 :            :         TET,
     357                 :            :         PYRAMID,
     358                 :            :         QUAD,
     359                 :            :         TRI,
     360                 :            :         EDGE,
     361                 :            :         NODE
     362                 :            :     };
     363                 :            :     static const EntityType group_type_to_mb_type[];
     364                 :            : 
     365                 :            :     enum
     366                 :            :     {
     367                 :            :         SPHERE_EXO = 0,
     368                 :            :         BAR,
     369                 :            :         BAR2,
     370                 :            :         BAR3,
     371                 :            :         BEAM,
     372                 :            :         BEAM2,
     373                 :            :         BEAM3,
     374                 :            :         TRUSS,
     375                 :            :         TRUSS2,
     376                 :            :         TRUSS3,
     377                 :            :         SPRING,
     378                 :            :         TRIthree,
     379                 :            :         TRI3,
     380                 :            :         TRI6,
     381                 :            :         TRI7,
     382                 :            :         TRISHELL,
     383                 :            :         TRISHELL3,
     384                 :            :         TRISHELL6,
     385                 :            :         TRISHELL7,
     386                 :            :         SHEL,
     387                 :            :         SHELL4,
     388                 :            :         SHELL8,
     389                 :            :         SHELL9,
     390                 :            :         QUADfour,
     391                 :            :         QUAD4,
     392                 :            :         QUAD5,
     393                 :            :         QUAD8,
     394                 :            :         QUAD9,
     395                 :            :         TETRAfour,
     396                 :            :         TETRA4,
     397                 :            :         TETRA8,
     398                 :            :         TETRA10,
     399                 :            :         TETRA14,
     400                 :            :         PYRAMIDfive,
     401                 :            :         PYRAMID5,
     402                 :            :         PYRAMID8,
     403                 :            :         PYRAMID13,
     404                 :            :         PYRAMID18,
     405                 :            :         HEXeight,
     406                 :            :         HEX8,
     407                 :            :         HEX9,
     408                 :            :         HEX20,
     409                 :            :         HEX27,
     410                 :            :         HEXSHELL,
     411                 :            :         INVALID_ELEMENT_TYPE
     412                 :            :     };
     413                 :            :     static const EntityType block_type_to_mb_type[];
     414                 :            :     static const int cub_elem_num_verts[];
     415                 :            :     static const int cub_elem_num_verts_len;
     416                 :            : 
     417                 :            :     //! mapping from mesh packet type to moab type
     418                 :            :     static const EntityType mp_type_to_mb_type[];
     419                 :            : 
     420                 :            :     //! get entities with individually-specified types; if is_group is false,
     421                 :            :     //! increment each mem_type by 2 since they're CSOEntityType's and not group types
     422                 :            :     ErrorCode get_entities( const unsigned int* mem_types, int* id_buf, const unsigned int id_buf_size,
     423                 :            :                             const bool is_group, std::vector< EntityHandle >& entities );
     424                 :            : 
     425                 :            :     //! get entities specified by type and ids, append to entities
     426                 :            :     ErrorCode get_entities( const unsigned int this_type, int* id_buf, const unsigned int id_buf_size,
     427                 :            :                             std::vector< EntityHandle >& entities, std::vector< EntityHandle >& excl_entities );
     428                 :            : 
     429                 :            :     //! get ref entity sets with specified type and ids
     430                 :            :     ErrorCode get_ref_entities( const unsigned int this_type, int* id_buf, const unsigned id_buf_size,
     431                 :            :                                 std::vector< EntityHandle >& entities );
     432                 :            : 
     433                 :            :     //! get mesh entities with specified type and ids
     434                 :            :     ErrorCode get_mesh_entities( const unsigned int this_type, int* id_buf, const unsigned id_buf_size,
     435                 :            :                                  std::vector< EntityHandle >& entities, std::vector< EntityHandle >& excl_entities );
     436                 :            : 
     437                 :            :     //! process entities in a sideset according to sense flags stored in uint_buf
     438                 :            :     //! or char_buf (depending on sense_size)
     439                 :            :     ErrorCode process_sideset_10( const int this_type, const int num_ents, const int sense_size,
     440                 :            :                                   std::vector< EntityHandle >& ss_entities, Tqdcfr::SidesetHeader* sideseth );
     441                 :            : 
     442                 :            :     ErrorCode process_sideset_11( std::vector< EntityHandle >& ss_entities, int num_wrts,
     443                 :            :                                   Tqdcfr::SidesetHeader* sideseth );
     444                 :            : 
     445                 :            :     // put entities into the specfied set, and excluded entities into a
     446                 :            :     // std::vector pointed to by the "Exclude_Entities" tag on that set
     447                 :            :     ErrorCode put_into_set( EntityHandle set_handle, std::vector< EntityHandle >& entities,
     448                 :            :                             std::vector< EntityHandle >& excl_entities );
     449                 :            : 
     450                 :            :     // look in metadatacontainer[set_index] for name data; if found, set name (and extra names,
     451                 :            :     // if multiple found) on set handle
     452                 :            :     ErrorCode get_names( MetaDataContainer& md, unsigned int set_index, EntityHandle seth );
     453                 :            : };
     454                 :            : 
     455                 :            : }  // namespace moab
     456                 :            : 
     457                 :            : #endif

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