LCOV - code coverage report
Current view: top level - src - SweptElementData.hpp (source / functions) Hit Total Coverage
Test: coverage_sk.info Lines: 0 3 0.0 %
Date: 2020-12-16 07:07:30 Functions: 0 2 0.0 %
Branches: 0 6 0.0 %

           Branch data     Line data    Source code
       1                 :            : /**
       2                 :            :  * MOAB, a Mesh-Oriented datABase, is a software component for creating,
       3                 :            :  * storing and accessing finite element mesh data.
       4                 :            :  *
       5                 :            :  * Copyright 2004 Sandia Corporation.  Under the terms of Contract
       6                 :            :  * DE-AC04-94AL85000 with Sandia Corporation, the U.S. Government
       7                 :            :  * retains certain rights in this software.
       8                 :            :  *
       9                 :            :  * This library is free software; you can redistribute it and/or
      10                 :            :  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
      11                 :            :  * License as published by the Free Software Foundation; either
      12                 :            :  * version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
      13                 :            :  *
      14                 :            :  */
      15                 :            : 
      16                 :            : #ifndef SWEPT_ELEMENT_DATA_HPP
      17                 :            : #define SWEPT_ELEMENT_DATA_HPP
      18                 :            : 
      19                 :            : //
      20                 :            : // Class: SweptElementData
      21                 :            : //
      22                 :            : // Purpose: represent a rectangular element of mesh
      23                 :            : //
      24                 :            : // A SweptElement represents a rectangular element of mesh, including both vertices and
      25                 :            : // elements, and the parametric space used to address that element.  Vertex data,
      26                 :            : // i.e. coordinates, may not be stored directly in the element, but the element returns
      27                 :            : // information about the vertex handles of vertices in the element.  Vertex and element
      28                 :            : // handles associated with the element are each contiguous.
      29                 :            : 
      30                 :            : #include "SequenceData.hpp"
      31                 :            : #include "moab/HomXform.hpp"
      32                 :            : #include "moab/CN.hpp"
      33                 :            : #include "SweptVertexData.hpp"
      34                 :            : #include "Internals.hpp"
      35                 :            : #include "moab/Range.hpp"
      36                 :            : 
      37                 :            : #include <vector>
      38                 :            : #include <algorithm>
      39                 :            : 
      40                 :            : namespace moab
      41                 :            : {
      42                 :            : 
      43                 :            : class SweptElementData : public SequenceData
      44                 :            : {
      45                 :            : 
      46                 :            :     //! structure to hold references to bounding vertex blocks
      47         [ #  # ]:          0 :     class VertexDataRef
      48                 :            :     {
      49                 :            :       private:
      50                 :            :         HomCoord minmax[2];
      51                 :            :         HomXform xform, invXform;
      52                 :            :         SweptVertexData* srcSeq;
      53                 :            : 
      54                 :            :       public:
      55                 :            :         friend class SweptElementData;
      56                 :            : 
      57                 :            :         VertexDataRef( const HomCoord& min, const HomCoord& max, const HomXform& tmp_xform, SweptVertexData* this_seq );
      58                 :            : 
      59                 :            :         bool contains( const HomCoord& coords ) const;
      60                 :            :     };
      61                 :            : 
      62                 :            :   private:
      63                 :            :     //! parameter min/max/stride, in homogeneous coords ijkh
      64                 :            :     HomCoord elementParams[3];
      65                 :            : 
      66                 :            :     //! difference between max and min params plus one (i.e. # VERTICES in
      67                 :            :     //! each parametric direction)
      68                 :            :     int dIJK[3];
      69                 :            : 
      70                 :            :     //! difference between max and min params (i.e. # ELEMENTS in
      71                 :            :     //! each parametric direction)
      72                 :            :     int dIJKm1[3];
      73                 :            : 
      74                 :            :     //! bare constructor, so compiler doesn't create one for me
      75                 :            :     SweptElementData();
      76                 :            : 
      77                 :            :     //! list of bounding vertex blocks
      78                 :            :     std::vector< VertexDataRef > vertexSeqRefs;
      79                 :            : 
      80                 :            :   public:
      81                 :            :     //! constructor
      82                 :            :     SweptElementData( EntityHandle start_handle, const int imin, const int jmin, const int kmin, const int imax,
      83                 :            :                       const int jmax, const int kmax, const int* Cq );
      84                 :            : 
      85                 :            :     virtual ~SweptElementData();
      86                 :            : 
      87                 :            :     //! get handle of vertex at homogeneous coords
      88                 :            :     inline EntityHandle get_vertex( const HomCoord& coords ) const;
      89                 :            :     inline EntityHandle get_vertex( int i, int j, int k ) const
      90                 :            :     {
      91                 :            :         return get_vertex( HomCoord( i, j, k ) );
      92                 :            :     }
      93                 :            : 
      94                 :            :     //! get handle of element at i, j, k
      95                 :            :     EntityHandle get_element( const int i, const int j, const int k ) const;
      96                 :            : 
      97                 :            :     //! get min params for this element
      98                 :            :     const HomCoord& min_params() const;
      99                 :            : 
     100                 :            :     //! get max params for this element
     101                 :            :     const HomCoord& max_params() const;
     102                 :            : 
     103                 :            :     //! get the number of vertices in each direction, inclusive
     104                 :            :     void param_extents( int& di, int& dj, int& dk ) const;
     105                 :            : 
     106                 :            :     //! given a handle, get the corresponding parameters
     107                 :            :     ErrorCode get_params( const EntityHandle ehandle, int& i, int& j, int& k ) const;
     108                 :            : 
     109                 :            :     //! convenience functions for parameter extents
     110                 :            :     int i_min() const
     111                 :            :     {
     112                 :            :         return ( elementParams[0].hom_coord() )[0];
     113                 :            :     }
     114                 :            :     int j_min() const
     115                 :            :     {
     116                 :            :         return ( elementParams[0].hom_coord() )[1];
     117                 :            :     }
     118                 :            :     int k_min() const
     119                 :            :     {
     120                 :            :         return ( elementParams[0].hom_coord() )[2];
     121                 :            :     }
     122                 :            :     int i_max() const
     123                 :            :     {
     124                 :            :         return ( elementParams[1].hom_coord() )[0];
     125                 :            :     }
     126                 :            :     int j_max() const
     127                 :            :     {
     128                 :            :         return ( elementParams[1].hom_coord() )[1];
     129                 :            :     }
     130                 :            :     int k_max() const
     131                 :            :     {
     132                 :            :         return ( elementParams[1].hom_coord() )[2];
     133                 :            :     }
     134                 :            : 
     135                 :            :     //! test the bounding vertex sequences and determine whether they fully
     136                 :            :     //! define the vertices covering this element block's parameter space
     137                 :            :     bool boundary_complete() const;
     138                 :            : 
     139                 :            :     //! test whether this sequence contains these parameters
     140                 :            :     inline bool contains( const HomCoord& coords ) const;
     141                 :            : 
     142                 :            :     //! get connectivity of an entity given entity's parameters
     143                 :            :     inline ErrorCode get_params_connectivity( const int i, const int j, const int k,
     144                 :            :                                               std::vector< EntityHandle >& connectivity ) const;
     145                 :            : 
     146                 :            :     //! add a vertex seq ref to this element sequence;
     147                 :            :     //! if bb_input is true, bounding box (in eseq-local coords) of vseq being added
     148                 :            :     //! is input in bb_min and bb_max (allows partial sharing of vseq rather than the whole
     149                 :            :     //! vseq); if it's false, the whole vseq is referenced and the eseq-local coordinates
     150                 :            :     //! is computed from the transformed bounding box of the vseq
     151                 :            :     ErrorCode add_vsequence( SweptVertexData* vseq, const HomCoord& p1, const HomCoord& q1, const HomCoord& p2,
     152                 :            :                              const HomCoord& q2, const HomCoord& p3, const HomCoord& q3, bool bb_input = false,
     153                 :            :                              const HomCoord& bb_min = HomCoord::unitv[0], const HomCoord& bb_max = HomCoord::unitv[0] );
     154                 :            : 
     155                 :            :     SequenceData* subset( EntityHandle start, EntityHandle end, const int* sequence_data_sizes,
     156                 :            :                           const int* tag_data_sizes ) const;
     157                 :            : 
     158                 :            :     static EntityID calc_num_entities( EntityHandle start_handle, int irange, int jrange, int krange );
     159                 :            : 
     160                 :            :     unsigned long get_memory_use() const;
     161                 :            : };
     162                 :            : 
     163                 :            : inline EntityHandle SweptElementData::get_element( const int i, const int j, const int k ) const
     164                 :            : {
     165                 :            :     return start_handle() + ( i - i_min() ) + ( j - j_min() ) * dIJKm1[0] + ( k - k_min() ) * dIJKm1[0] * dIJKm1[1];
     166                 :            : }
     167                 :            : 
     168                 :            : inline const HomCoord& SweptElementData::min_params() const
     169                 :            : {
     170                 :            :     return elementParams[0];
     171                 :            : }
     172                 :            : 
     173                 :            : inline const HomCoord& SweptElementData::max_params() const
     174                 :            : {
     175                 :            :     return elementParams[1];
     176                 :            : }
     177                 :            : 
     178                 :            : //! get the number of vertices in each direction, inclusive
     179                 :            : inline void SweptElementData::param_extents( int& di, int& dj, int& dk ) const
     180                 :            : {
     181                 :            :     di = dIJK[0];
     182                 :            :     dj = dIJK[1];
     183                 :            :     dk = dIJK[2];
     184                 :            : }
     185                 :            : 
     186                 :            : inline ErrorCode SweptElementData::get_params( const EntityHandle ehandle, int& i, int& j, int& k ) const
     187                 :            : {
     188                 :            :     if( TYPE_FROM_HANDLE( ehandle ) != TYPE_FROM_HANDLE( start_handle() ) ) return MB_FAILURE;
     189                 :            : 
     190                 :            :     int hdiff = ehandle - start_handle();
     191                 :            : 
     192                 :            :     // use double ?: test below because on some platforms, both sides of the : are
     193                 :            :     // evaluated, and if dIJKm1[1] is zero, that'll generate a divide-by-zero
     194                 :            :     k = ( dIJKm1[1] > 0 ? hdiff / ( dIJKm1[1] > 0 ? dIJKm1[0] * dIJKm1[1] : 1 ) : 0 );
     195                 :            :     j = ( hdiff - ( k * dIJKm1[0] * dIJKm1[1] ) ) / dIJKm1[0];
     196                 :            :     i = hdiff % dIJKm1[0];
     197                 :            : 
     198                 :            :     k += elementParams[0].k();
     199                 :            :     j += elementParams[0].j();
     200                 :            :     i += elementParams[0].i();
     201                 :            : 
     202                 :            :     return ( ehandle >= start_handle() && ehandle < start_handle() + size() && i >= i_min() && i <= i_max() &&
     203                 :            :              j >= j_min() && j <= j_max() && k >= k_min() && k <= k_max() )
     204                 :            :                ? MB_SUCCESS
     205                 :            :                : MB_FAILURE;
     206                 :            : }
     207                 :            : 
     208                 :            : inline bool SweptElementData::contains( const HomCoord& temp ) const
     209                 :            : {
     210                 :            :     // upper bound is < instead of <= because element params max is one less
     211                 :            :     // than vertex params max
     212                 :            :     return ( temp >= elementParams[0] && temp < elementParams[1] );
     213                 :            : }
     214                 :            : 
     215                 :          0 : inline bool SweptElementData::VertexDataRef::contains( const HomCoord& coords ) const
     216                 :            : {
     217 [ #  # ][ #  # ]:          0 :     return ( minmax[0] <= coords && minmax[1] >= coords );
     218                 :            : }
     219                 :            : 
     220                 :            : inline SweptElementData::VertexDataRef::VertexDataRef( const HomCoord& this_min, const HomCoord& this_max,
     221                 :            :                                                        const HomXform& tmp_xform, SweptVertexData* this_seq )
     222                 :            :     : xform( tmp_xform ), invXform( tmp_xform.inverse() ), srcSeq( this_seq )
     223                 :            : {
     224                 :            :     minmax[0] = HomCoord( this_min );
     225                 :            :     minmax[1] = HomCoord( this_max );
     226                 :            : }
     227                 :            : 
     228                 :            : inline EntityHandle SweptElementData::get_vertex( const HomCoord& coords ) const
     229                 :            : {
     230                 :            :     assert( boundary_complete() );
     231                 :            :     for( std::vector< VertexDataRef >::const_iterator it = vertexSeqRefs.begin(); it != vertexSeqRefs.end(); ++it )
     232                 :            :     {
     233                 :            :         if( ( *it ).minmax[0] <= coords && ( *it ).minmax[1] >= coords )
     234                 :            :         {
     235                 :            :             // first get the vertex block-local parameters
     236                 :            :             HomCoord local_coords = coords / ( *it ).xform;
     237                 :            : 
     238                 :            :             // now get the vertex handle for those coords
     239                 :            :             return ( *it ).srcSeq->get_vertex( local_coords );
     240                 :            :         }
     241                 :            :     }
     242                 :            : 
     243                 :            :     // got here, it's an error
     244                 :            :     return 0;
     245                 :            : }
     246                 :            : 
     247                 :            : inline ErrorCode SweptElementData::add_vsequence( SweptVertexData* vseq, const HomCoord& p1, const HomCoord& q1,
     248                 :            :                                                   const HomCoord& p2, const HomCoord& q2, const HomCoord& p3,
     249                 :            :                                                   const HomCoord& q3, bool bb_input, const HomCoord& bb_min,
     250                 :            :                                                   const HomCoord& bb_max )
     251                 :            : {
     252                 :            :     // compute the transform given the vseq-local parameters and the mapping to
     253                 :            :     // this element sequence's parameters passed in minmax
     254                 :            :     HomXform M;
     255                 :            :     M.three_pt_xform( p1, q1, p2, q2, p3, q3 );
     256                 :            : 
     257                 :            :     // min and max in element seq's parameter system may not be same as those in
     258                 :            :     // vseq's system, so need to take min/max
     259                 :            : 
     260                 :            :     HomCoord minmax[2];
     261                 :            :     if( bb_input )
     262                 :            :     {
     263                 :            :         minmax[0] = bb_min;
     264                 :            :         minmax[1] = bb_max;
     265                 :            :     }
     266                 :            :     else
     267                 :            :     {
     268                 :            :         minmax[0] = vseq->min_params() * M;
     269                 :            :         minmax[1] = vseq->max_params() * M;
     270                 :            :     }
     271                 :            : 
     272                 :            :     // check against other vseq's to make sure they don't overlap
     273                 :            :     for( std::vector< VertexDataRef >::const_iterator vsit = vertexSeqRefs.begin(); vsit != vertexSeqRefs.end();
     274                 :            :          ++vsit )
     275                 :            :         if( ( *vsit ).contains( minmax[0] ) || ( *vsit ).contains( minmax[1] ) ) return MB_FAILURE;
     276                 :            : 
     277                 :            :     HomCoord tmp_min( std::min( minmax[0].i(), minmax[1].i() ), std::min( minmax[0].j(), minmax[1].j() ),
     278                 :            :                       std::min( minmax[0].k(), minmax[1].k() ) );
     279                 :            :     HomCoord tmp_max( std::max( minmax[0].i(), minmax[1].i() ), std::max( minmax[0].j(), minmax[1].j() ),
     280                 :            :                       std::max( minmax[0].k(), minmax[1].k() ) );
     281                 :            : 
     282                 :            :     // set up a new vertex sequence reference
     283                 :            :     VertexDataRef tmp_seq_ref( tmp_min, tmp_max, M, vseq );
     284                 :            : 
     285                 :            :     // add to the list
     286                 :            :     vertexSeqRefs.push_back( tmp_seq_ref );
     287                 :            : 
     288                 :            :     return MB_SUCCESS;
     289                 :            : }
     290                 :            : 
     291                 :            : inline ErrorCode SweptElementData::get_params_connectivity( const int i, const int j, const int k,
     292                 :            :                                                             std::vector< EntityHandle >& connectivity ) const
     293                 :            : {
     294                 :            :     if( contains( HomCoord( i, j, k ) ) == false ) return MB_FAILURE;
     295                 :            : 
     296                 :            :     connectivity.push_back( get_vertex( i, j, k ) );
     297                 :            :     connectivity.push_back( get_vertex( i + 1, j, k ) );
     298                 :            :     if( CN::Dimension( TYPE_FROM_HANDLE( start_handle() ) ) < 2 ) return MB_SUCCESS;
     299                 :            :     connectivity.push_back( get_vertex( i + 1, j + 1, k ) );
     300                 :            :     connectivity.push_back( get_vertex( i, j + 1, k ) );
     301                 :            :     if( CN::Dimension( TYPE_FROM_HANDLE( start_handle() ) ) < 3 ) return MB_SUCCESS;
     302                 :            :     connectivity.push_back( get_vertex( i, j, k + 1 ) );
     303                 :            :     connectivity.push_back( get_vertex( i + 1, j, k + 1 ) );
     304                 :            :     connectivity.push_back( get_vertex( i + 1, j + 1, k + 1 ) );
     305                 :            :     connectivity.push_back( get_vertex( i, j + 1, k + 1 ) );
     306                 :            :     return MB_SUCCESS;
     307                 :            : }
     308                 :            : 
     309                 :            : }  // namespace moab
     310                 :            : 
     311                 :            : #endif

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