LCOV - code coverage report
Current view: top level - src/io/mhdf/src - adjacency.c (source / functions) Hit Total Coverage
Test: coverage_sk.info Lines: 38 54 70.4 %
Date: 2020-12-16 07:07:30 Functions: 5 7 71.4 %
Branches: 11 24 45.8 %

           Branch data     Line data    Source code
       1                 :            : /**
       2                 :            :  * MOAB, a Mesh-Oriented datABase, is a software component for creating,
       3                 :            :  * storing and accessing finite element mesh data.
       4                 :            :  *
       5                 :            :  * Copyright 2004 Sandia Corporation.  Under the terms of Contract
       6                 :            :  * DE-AC04-94AL85000 with Sandia Corporation, the U.S. Government
       7                 :            :  * retains certain rights in this software.
       8                 :            :  *
       9                 :            :  * This library is free software; you can redistribute it and/or
      10                 :            :  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
      11                 :            :  * License as published by the Free Software Foundation; either
      12                 :            :  * version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
      13                 :            :  *
      14                 :            :  */
      15                 :            : 
      16                 :            : #include <H5Tpublic.h>
      17                 :            : #include <H5Gpublic.h>
      18                 :            : #include <H5Ppublic.h>
      19                 :            : #include "mhdf.h"
      20                 :            : #include "util.h"
      21                 :            : #include "file-handle.h"
      22                 :            : #include "status.h"
      23                 :            : #include "names-and-paths.h"
      24                 :            : 
      25                 :        109 : int mhdf_haveAdjacency( mhdf_FileHandle file, const char* elem_group, mhdf_Status* status )
      26                 :            : {
      27                 :            :     FileHandle* file_ptr;
      28                 :            :     hid_t       elem_id;
      29                 :            :     int         result;
      30                 :            :     API_BEGIN;
      31                 :            : 
      32                 :        109 :     file_ptr = (FileHandle*)( file );
      33         [ -  + ]:        109 :     if( !mhdf_check_valid_file( file_ptr, status ) ) return -1;
      34                 :            : 
      35         [ -  + ]:        109 :     if( elem_group == mhdf_node_type_handle( ) )
      36                 :            :     {
      37                 :            : #if defined( H5Gopen_vers ) && H5Gopen_vers > 1
      38                 :          0 :         elem_id = H5Gopen( file_ptr->hdf_handle, NODE_GROUP, H5P_DEFAULT );
      39                 :            : #else
      40                 :            :         elem_id = H5Gopen( file_ptr->hdf_handle, NODE_GROUP );
      41                 :            : #endif
      42         [ #  # ]:          0 :         if( elem_id < 0 )
      43                 :            :         {
      44                 :          0 :             mhdf_setFail( status, "H5Gopen( \"%s\" ) failed.\n", NODE_GROUP );
      45                 :          0 :             return -1;
      46                 :            :         }
      47                 :            :     }
      48                 :            :     else
      49                 :            :     {
      50                 :        109 :         elem_id = mhdf_elem_group_from_handle( file_ptr, elem_group, status );
      51         [ -  + ]:        109 :         if( elem_id < 0 ) return -1;
      52                 :            :     }
      53                 :            : 
      54                 :        109 :     result = mhdf_is_in_group( elem_id, ADJACENCY_NAME, status );
      55                 :        109 :     H5Gclose( elem_id );
      56                 :        109 :     mhdf_setOkay( status );
      57                 :            :     API_END;
      58                 :        109 :     return result;
      59                 :            : }
      60                 :            : 
      61                 :          2 : hid_t mhdf_createAdjacency( mhdf_FileHandle file, const char* elem_handle, long adj_list_size, mhdf_Status* status )
      62                 :            : {
      63                 :            :     FileHandle* file_ptr;
      64                 :            :     hid_t       elem_id, table_id;
      65                 :          2 :     hsize_t     dim = (hsize_t)adj_list_size;
      66                 :            :     API_BEGIN;
      67                 :            : 
      68                 :          2 :     file_ptr = (FileHandle*)( file );
      69         [ -  + ]:          2 :     if( !mhdf_check_valid_file( file_ptr, status ) ) return -1;
      70                 :            : 
      71         [ -  + ]:          2 :     if( adj_list_size < 1 )
      72                 :            :     {
      73                 :          0 :         mhdf_setFail( status, "Invalid argument.\n" );
      74                 :          0 :         return -1;
      75                 :            :     }
      76                 :            : 
      77         [ -  + ]:          2 :     if( elem_handle == mhdf_node_type_handle( ) )
      78                 :          0 :     { table_id = mhdf_create_table( file_ptr->hdf_handle, NODE_ADJCY_PATH, file_ptr->id_type, 1, &dim, status ); }
      79                 :            :     else
      80                 :            :     {
      81                 :          2 :         elem_id = mhdf_elem_group_from_handle( file_ptr, elem_handle, status );
      82         [ -  + ]:          2 :         if( elem_id < 0 ) return -1;
      83                 :            : 
      84                 :          2 :         table_id = mhdf_create_table( elem_id, ADJACENCY_NAME, file_ptr->id_type, 1, &dim, status );
      85                 :          2 :         H5Gclose( elem_id );
      86                 :            :     }
      87                 :            : 
      88                 :            :     API_END_H( 1 );
      89                 :          2 :     return table_id;
      90                 :            : }
      91                 :            : 
      92                 :          5 : hid_t mhdf_openAdjacency( mhdf_FileHandle file, const char* elem_handle, long* adj_list_size_out, mhdf_Status* status )
      93                 :            : 
      94                 :            : {
      95                 :            :     FileHandle* file_ptr;
      96                 :            :     hid_t       elem_id, table_id;
      97                 :            :     hsize_t     dim;
      98                 :            :     API_BEGIN;
      99                 :            : 
     100                 :          5 :     file_ptr = (FileHandle*)( file );
     101         [ -  + ]:          5 :     if( !mhdf_check_valid_file( file_ptr, status ) ) return -1;
     102                 :            : 
     103         [ -  + ]:          5 :     if( !adj_list_size_out )
     104                 :            :     {
     105                 :          0 :         mhdf_setFail( status, "Invalid argument.\n" );
     106                 :          0 :         return -1;
     107                 :            :     }
     108                 :            : 
     109         [ -  + ]:          5 :     if( elem_handle == mhdf_node_type_handle( ) )
     110                 :          0 :     { table_id = mhdf_open_table( file_ptr->hdf_handle, NODE_ADJCY_PATH, 1, &dim, status ); }
     111                 :            :     else
     112                 :            :     {
     113                 :          5 :         elem_id = mhdf_elem_group_from_handle( file_ptr, elem_handle, status );
     114         [ -  + ]:          5 :         if( elem_id < 0 ) return -1;
     115                 :          5 :         table_id = mhdf_open_table( elem_id, ADJACENCY_NAME, 1, &dim, status );
     116                 :          5 :         H5Gclose( elem_id );
     117                 :            :     }
     118                 :            : 
     119                 :          5 :     *adj_list_size_out = (long)dim;
     120                 :            :     API_END_H( 1 );
     121                 :          5 :     return table_id;
     122                 :            : }
     123                 :            : 
     124                 :          0 : void mhdf_writeAdjacency( hid_t table_id, long offset, long count, hid_t type, const void* data, mhdf_Status* status )
     125                 :            : {
     126                 :            :     API_BEGIN;
     127                 :          0 :     mhdf_write_data( table_id, offset, count, type, data, H5P_DEFAULT, status );
     128                 :            :     API_END;
     129                 :          0 : }
     130                 :            : 
     131                 :          2 : void mhdf_writeAdjacencyWithOpt( hid_t table_id, long offset, long count, hid_t type, const void* data, hid_t prop,
     132                 :            :                                  mhdf_Status* status )
     133                 :            : {
     134                 :            :     API_BEGIN;
     135                 :          2 :     mhdf_write_data( table_id, offset, count, type, data, prop, status );
     136                 :            :     API_END;
     137                 :          2 : }
     138                 :            : 
     139                 :          0 : void mhdf_readAdjacency( hid_t table_id, long offset, long count, hid_t type, void* data, mhdf_Status* status )
     140                 :            : {
     141                 :            :     API_BEGIN;
     142                 :          0 :     mhdf_read_data( table_id, offset, count, type, data, H5P_DEFAULT, status );
     143                 :            :     API_END;
     144                 :          0 : }
     145                 :          3 : void mhdf_readAdjacencyWithOpt( hid_t table_id, long offset, long count, hid_t type, void* data, hid_t prop,
     146                 :            :                                 mhdf_Status* status )
     147                 :            : {
     148                 :            :     API_BEGIN;
     149                 :          3 :     mhdf_read_data( table_id, offset, count, type, data, prop, status );
     150                 :            :     API_END;
     151                 :          3 : }

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